高温高压灭菌器必须采用蒸馏水作为工作介质。即使是纯净水，也含有各种矿物质，在高温下蒸发会产生水垢，一段时候以后，水垢会使电磁阀密封不严，导致蒸汽泄露；还会引起细小管路、压力传感器堵塞，及温度传感器失灵等故障。而且在灭菌室内的小型有孔器械，进入的水垢易堵塞细小管道和轴承，使器械的性能降低，并影响使用寿命。由此可见，使用蒸馏水非常重要。
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